کورس تعلیم و تربیه اسلامی صنف دوازدهم یکی از مضامین مهم نصاب تعلیمی افغانستان است که هدف اساسی آن تربیه فکری، اخلاقی و دینی شاگردان می‌باشد. در این کورس، شاگردان با مفاهیم بنیادی دین اسلام مانند قرآن کریم به عنوان کتاب هدایت و نور، ایمان به الله، ایمان به آخرت، شوری، اجماع، اعتدال و میانه‌روی، عدالت اجتماعی، جایگاه انبیا علیهم‌السلام و ارزش‌های اخلاقی اسلام آشنا می‌شوند. همچنان موضوعاتی مانند حرمت خون انسان، احترام به مال دیگران، اهمیت آگاهی از دین، همزیستی و مدارا، نقش جوانان در اصلاح جامعه و دیگر اصول مهم اسلامی به شکل منظم و قابل فهم بررسی می‌گردد.

در این کورس آیات قرآن کریم به صورت ساده تفسیر می‌شود تا شاگردان بتوانند پیام‌های الهی را در زندگی روزمره خود تطبیق دهند و تنها به معلومات نظری اکتفا نکنند، بلکه آن را در عمل نیز به کار ببرند. هدف اصلی این مضمون آن است که شاگردان شخصیت دینی، اخلاقی و اجتماعی سالم بسازند، مسئولیت‌پذیر باشند و زندگی خود را بر اساس هدایت قرآن کریم و سنت پیامبر اکرم ﷺ تنظیم کنند. به همین دلیل این کورس نقش مهمی در تربیه نسل آگاه، باایمان و مفید برای جامعه دارد که بتواند در آینده در اصلاح و پیشرفت جامعه اسلامی سهم مثبت بگیرد.